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服务篇 | 全基因组测序服务

来源: | 作者:/ | 发布时间: 2023-12-12 | 278 次浏览 | 分享到:


全基因组测序(Whole genome sequencing，WGS)是一种获得物种基因组的整个编码区(外显子)和非编码区的实验室技术。一次的测序实验，可获得相应物种的全部基因信息：如单核苷酸多态性(SNP)、拷贝数变异(SNV)、插入缺失(Indel)等。这种测序方法在没有参考基因组或者可参考基因组质量较差时，发挥着重要的作用。


测序平台




分析项目



基因结构预测与功能注释



测序数据质控分析



高质量基因组组装



蛋白结构注释



重复序列分析



代谢功能注释



其他个性化分析

         ......



测序优势


经验加成

测序经验丰富


报告周期短

最快7个工作日获取测序报告


高准确率

Raw read accuracy，

99.5%(Q23）


定制化测序方案

可根据实际需求制定个性化

测序方案


长度长测序

在基因组组装、结构变异、

表观修饰等方面有很大优势



技术路线





建库样本要求


外观

DNA样本澄清透明，无杂质、无粘稠现象。


OD值

260/280=1.8~2.0；

260/230≥2.0~2.2。


总量

总量≥2ug；

或浓度≥25ng/ul；

且总体积≥100ul；



图片


[1] Nurk S, Koren S, Rhie A, et al. The complete sequence of a human genome. Science. 2022;376(6588):44-53.

[2] Li A, Liu A, Du X, Chen JY, Yin M, Hu HY, Shrestha N, Wu SD, Wang HQ, Dou QW, Liu ZP, Liu JQ, Yang YZ, Ren GP. A chromosome-scale genome assembly of a diploid alfalfa, the progenitor of autotetraploid alfalfa. Hortic Res. 2020 Dec 1;7(1):194.

[3] Xie G, Zhang X, Lv F, Sang M, Hu H, Wang J, Liu D. Nanopore Sequencing and Hi-C Based De Novo Assembly of Trachidermus fasciatus Genome. Genes (Basel). 2021 May 6;12(5):692.