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热点技术 | 微滴式数字PCR—始于微滴,发现未知

 

  数字PCR是最新的一代PCR技术,一种全新的对核酸进行检测和定量的方法,它采用直接计数目标分子而不再依赖任何校准物或外标,即可确定低至单拷贝的待检靶分子的绝对数目。

 

一、技术原理

  微滴式数字PCR系统在传统的PCR扩增前对样品进行微滴化处理,即将含有核酸分子的反应体系分成成千上万个纳升级的微滴,其中每个微滴或不含待检核酸靶分子,或者含有一个至数个待检核酸靶分子。经PCR扩增后,逐个对每个微滴进行检测,有荧光信号的微滴判读为1,没有荧光信号的微滴判读为0,根据泊松分布原理及阳性微滴的个数与比例即可得出靶分子的起始拷贝数或浓度。

 

 

技术原理图

二、技术优势

 

1.真正意义上的绝对定量

§无需标准曲线;检测下限可低至单拷贝

§不依赖Ct值,不依赖扩增效率,能克服PCR抑制剂的影响

 

2.高灵敏度、高特异性检测复杂背景下的靶标序列

§灵敏度最高可达0.001%Sanger法测序:10%ARMS-PCR法:0.1%

§样本核酸存在降解时的较佳选择,在穿刺样本、胸腹水、外周血中即可完成靶标序列的检测

 

3.所需样本量少

§微量样本、单细胞、样本珍贵

 

4.实验数据分析便捷

§每个微滴的检测结果以阴、阳性判读,数据分析自动化

 

5.使用灵活,可按实验需要调整通量和灵敏度

§高通量:一次运行可检测96个样本

§高灵敏度:合并分析96孔,一个样本多于140万微滴

 

三、技术运用

 

肿瘤分子标志物研究——检测稀有靶标DNA分子拷贝数含量、拷贝数变异状态以及等位基因分型

病原体检测器——检测生物样本中的循环DNA,具有超高精确度

基因表达分析——稳定定量低丰度mRNAmiRNA,无需标准曲线

二代测序——无需标准曲线即可定量NGS测序文库,并验证NGS结果

环境科学——广泛用于各种环境样本的定性检测

食品安全——食品中基因改造生物(GMO)成分常规检测的有限手段

 

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