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讨论：关于《Nature》对Western Blot图片的要求


《Nature》期刊是允许对Blots图片进行剪切的，但是剪切必须要在图注中进行说明，同时《Nature》也提到了一些期刊要求必须在文章增补信息中提供完整的blots图片。裁剪后的Blots图必须有一定的宽度“上下各6个条带的宽度”（不要过窄，以掩盖一些必要信息）。高对比度的blots图片是不允许的，因为这会掩盖一些附加条带信息。投稿者应尽量曝光出带有灰色背景的图片，若高对比度blots不可避免，也应在增补信息中提供多次曝光的图片（以说明没有掩盖其他信息）。

 

 

什么是高对比度blots图片？我们来看一下其他期刊高对比度blots的示例：

 

（Journal of Cell Science，Best Practices: gels, blots and images in JCS figures）

 

（Journal of Biological Chemistry, Good practices for preparing publication-quality figures）

 

（The Journal of Experimental Medicine，Gel Image Guide 2016）

 


对于灰度图像，每个象素用一个字节（8bit）表示，一幅图像可以有256级灰度；若每个象素用两个字节（16bit）表示，一幅图像可以有65536级灰度。为了保留更多实验细节，16bit 的TIF图像更为常见。所以，千万不要以为某些8bit数据能给您带来更好的结果体验（背景干净，条带清晰），它也许会给您带来文章被拒的风险！Journal of Cell Science已经明确表示，这样的文章有可能会因此被拒收。

 

 

我们一起来“学习”一下8bit的blot数据，看看问题出在哪里。这是一幅用ImageJ软件打开的8bit化学发光图，几乎没有背景信息（属于高对比度类型，需要调整对比度，以显示灰色背景）。

 

 

当我们调整对比度以后会发现依然有很多背景信息丢失，而且图片颗粒感很强！图片质量很差！根本无法显示成像对象的细节信息！

 

 

真正的16bit数据在调整对比度后，可以显示出均一、细腻的灰色背景。我们可以发现，这原来是在96孔板上的化学发光信号（将二抗比例稀释后，加入ECL底物）。但在8bit的TIF图片上，根本无法显示出这样的背景信息。特别是按照《Nature》要求调整出来的背景后，图片质量无法令人满意，文章有可能会被拒绝发表！